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公司没有注册并不一定都是有问题的。在某些情况下，公司尚未完成注册可能是由于各种原因，例如正在筹备阶段、正在等待审批等。然而，如果公司长期未注册或存在其他违法行为，则可能存在一些问题。因此，在考虑与未注册的公司合作或投资时，需要谨慎评估风险并了解具体情况。
合法经营的公司都需要进行注册登记，包括在相关政府部门登记备案、获得营业执照等，未注册的公司可能缺乏合法性和稳定性，可能存在经营风险、法律风险等，未注册的公司也可能存在欺诈、非法经营等违法行为，这些行为可能会损害投资者和合作伙伴的利益。
在选择合作伙伴或投资对象时，建议优先选择已经合法注册的公司，如果与未注册的公司合作或投资，需要充分了解其背景、信誉、经营状况等信息，并谨慎评估风险，也需要注意合同条款和细节，确保自身权益得到充分保障。